Human immunodeficiency virus tipe 1 (HIV-1) masih menjadi masalah kesehatan yang serius di Indonesia. Indonesia sebagai negara dengan tingkat infeksi HIV-1 yang tinggi di Asia Tenggara, sehingga Indonesia memiliki kontribusi besar pada penyebaran HIV ke negara- negara Asia lainnya, khususnya dalam penyebaran strain CRF01_AE. Secara khusus, CRF01_AE merupakan strain HIV-1 yang dominan di berbagai daerah di Indonesia.
Namun, informasi mengenai karakteristik evolusi dan penyebaran strain HIV-1 CRF01_AE secara spasial-temporal di Indonesia masih terbatas. Oleh karena itu, penelitian ini mengkaji pola penyebaran secara spasial-temporal dan karakteristik evolusi HIV-1 CRF01_AE di Indonesia. Untuk mengetahui hubungan epidemiologi strain HIV-1 CRF01_AE baik di Indonesia dan seluruh dunia, kami melakukan studi dengan pendekatan filogenetik berdasarkan sekuen nearly full-genome pada strain HIV-1 CRF01_AE yang diisolasi di Indonesia.
Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa strain HIV-1 CRF01_AE di Indonesia diklasifikasikan menjadi lima kluster yang berbeda, yaitu kluster IDN 1; kluster IDN 2; kluster IDN 3; kluster IDN 4; dan kluster IDN 5. Untuk menentukan sumber potensial dan cara penularan CRF01_AE, kami melakukan analisis Bayesian dan membangun pohon filogenetik dengan metode maximum clade credibility untuk setiap klusternya. Penelitian kami menunjukkan bahwa strain HIV-1 CRF01_AE umumnya masuk ke Indonesia dari Asia Tenggara, khususnya Thailand. Thailand merupakan negara yang menjadi episentrum epidemi HIV-1 CRF01_AE di dunia. Strain CRF01_AE dari Thailand mempunyai peranan penting sebagai penyebar utama dalam epidemi secara global HIV-1 CRF01_AE (hampir menyebar ke sekitar 17-20 negara-negara di Eropa). Bahkan Inggris, Slovenia, Swiss, dan Austria termasuk negara yang mengimpor strain CRF01_AE dari Thailand.
Penulis: Prof. Dr. Nasronudin, dr., Sp.PD-KPTI
Detail tulisan ini dapat dilihat di:
Siti Qamariyah Khairunisa, Dwi Wahyu Indriati, Ni Luh Ayu Megasari, Shuhei Ueda, Tomohiro Kotaki, Muhamad Fahmi, Masahiro Ito, Brian Eka Rachman, Afif Nurul Hidayati, Nasronudin & Masanori Kameoka. Spatial–temporal transmission dynamics of HIV-1 CRF01_AE in Indonesia. Article number: 9917 (2024)
