Penyakit Coronavirus (COVID-19), yang disebabkan oleh novel coronavirus terdeteksi pada Desember 2019 di Wuhan, China untuk pertama kalinya dan menyebar dengan cepat menjadi pandemi global. Kajian ini bertujuan untuk memprediksi potensi senyawa bioaktif makroalga sebagai antivirus SARS-CoV-2 dengan menghambat reseptor ACE2 melalui pendekatan in silico. Dua puluh tujuh senyawa makroalga diperoleh dari PubChem (NCBI, USA), sedangkan reseptor ACE2 protein target dikumpulkan dari Protein Data Bank (PDB). Kemudian skrining kemiripan obat dilakukan dengan aturan Lipinski dari lima server web dan prediksi senyawa bioaktif dilakukan dengan PASS (Prediksi spektrum aktivitas untuk zat aktif biologis) melalui online server web.
Setelah senyawa tersebut disetujui oleh aturan lima Lipinski dan PASS online server web prediksi, simulasi blind docking dilakukan dengan perangkat lunak PyRx 0.8 untuk menunjukkan nilai energi ikat. Analisis interaksi molekuler dilakukan dengan BIOVIA Discovery Studio 2016 v16.1.0 dan perangkat lunak PyMOL v2.4.1. Ada enam senyawa makroalga yang disetujui oleh aturan Lipinski dan Analisis PASS Online. Hasilnya adalah senyawa makroalga siphonaxanthin di antara 27 senyawa makroalga menunjukkan energi ikat yang kuat untuk mengikat reseptor ACE2 dengan nilai -8,8 kkal/mol. Penelitian ini juga menggunakan obat SARS-CoV-2 sebagai kontrol positif yaitu remdesivir, molnupiravir, baricitinib, lopinavir, oseltamivir, dan favipiravir. Hasil penelitian menunjukkan bahwa siphonaxanthin memiliki energi ikat paling rendah dibandingkan dengan obat umum SARS-CoV-2. Senyawa makroalga diprediksi berpotensi sebagai SARS-CoV-2 antivirus. Dengan demikian, studi selanjutnya perlu diselidiki dengan analisis in vitro dan in vivo untuk konfirmasi aktivitas penghambatan siphonaxanthin terhadap SARS-CoV-2.
Penulis: Teguh Hari Sucipto, Hasriaton Padmi, Rahadian Zainul dkk.
Judul Artikel: Macroalgae Bioactive Compounds for the Potential Antiviral of SARS-CoV-2: An In Silico Study
Informasi detail tentang artikel ilmiah ini dapat dilihat di: https://microbiologyjournal.org/macroalgae-bioactive-compounds-for-the-potential-antiviral-of-sars-cov-2-an-in-silico-study/
