Indonesia merupakan negara maritim yang terdiri lebih dari 17.000 pulau yang tersebar di Samudra Pasifik dan Hindia, menghubungkan daratan Asia dengan dunia Pasifik. Dilihat dari luas daratannya, Indonesia merupakan salah satu daerah dengan keragaman suku, bahasa, dan genetik yang paling beragam (Tumonggor et al., 2013).

Minangkabau adalah kelompok etnis mayoritas di Sumatera Barat, Indonesia. Sumatera Barat memiliki luas wilayah 42.013 km, dan populasi adalah 5.580.232 orang. Gempa bumi sering terjadi di sepanjang pantai barat Sumatera, baik di darat maupun di bawah laut. Tingkat tinggi dari gempa bumi terutama yang terjadi di bawah laut berpotensi menimbulkan tsunami. (BPS Sumbar, 2021).

Sejak lokus terakhir CODIS terletak di dalam ESS (European Standard Set of Loci), kit GlobalFillerSTR telah menjadi sistem global yang menggabungkan wilayah CODIS dan ESS. Kit STR GlobalFiller digunakan dalam penelitian kami karena perbedaan ini fitur. Tahap pertama dalam analisis DNA adalah menentukan profil DNA dari sampel biologis dan interpretasi data diperoleh dari DNA ini. Untuk menginterpretasikan bukti yang diperoleh dari molekul DNA dengan benar, perlu diketahui seberapa sering genetik tanda-tanda terlihat pada populasi yang relevan (Canpolat et al., 2021).

Variasi dan frekuensi alel di setiap lokus hanya dapat ditentukan melalui studi yang dilakukan pada setiap populasi. Jadi, frekuensi alel penanda genetik yang digunakan dalam ilmu forensik harus ditentukan untuk setiap populasi, dan database harus dibuat. Sangat penting untuk menggunakan database masyarakat yang akurat dalam statistik perhitungan yang dilakukan untuk mengevaluasi hasil analisis DNA (Goodwin, W., Linacre, A., Hadi, 2007). Studi analisis genetik STR lokus suku Minangkabau belum banyak diketahui

Dalam penelitian ini, sampel darah lengkap diperoleh dari 25 individu sehat yang tidak terkait dari populasi Minangkabau. Penjelasan dan persetujuan diperoleh dari semua individu. Penelitian ini mendapat persetujuan etik dari komite etik penelitian Fakultas Kedokteran, Universitas Andalas 414/UN.16.2/KEP-FK/2021.

Hasil penelitian menunjukkan frekuensi alel yang teramati untuk 21 lokus STR suku Minangkabau di Indonesia ada 162 alel dengan rentang frekuensi 0,02 – 0,36. Alel yang paling sering adalah 9 di lokus TH01. Jenis alel yang paling sering untuk masing-masing lokus adalah: CSF1PO:12, TPOX:11, TH01:9, D13S317:9, D16S539:12, D18S51:14, D21S11:30, D8S1179:13, D7S820:11, D5S818: 12, D3S1358: 15, FGA 22, vWA: 18, D10S1248: 15, D12S381: 20, D19S433: 13, D1S1656: 15, D22S1045: 16, D2S1338: 24, D2S441: 14, SE33: 28.2

Keanekaragaman alel ditunjukkan pada tabel 2. Varietas alel yang paling banyak terdapat pada lokus SE33, terdapat 17 jenis alel (13-33.2). Heterozigositas yang diharapkan (He), kekuatan diskriminasi, probabilitas kecocokan, probabilitas pengecualian, informasi polimorfik

konten, dan chi-kuadrat untuk keseimbangan Hardy Weinberg (HWE) untuk setiap lokus dihitung. Heterozigositas yang diharapkan berkisar dari 0,691 (TPOX) hingga 0,904 (SE33). Kekuatan diskriminasi berkisar dari 0,847 untuk lokus TPOX hingga 0,983 untuk SE33 tempat. Probabilitas pengecualian berkisar dari 0,42 untuk lokus TPOX hingga 0,81 untuk lokus SE33. Probabilitas pertandingan berkisar dari 0,03 untuk lokus TPOX, D5S818, D22S1045 hingga 0,107 untuk lokus D2S441. Konten informasi polimorfik berkisar dari 0,610 (TH01) hingga 0,690 (D13S317). Kekuatan gabungan diskriminasi dalam populasi Minangkabau (CPD) adalah 92,43% dan probabilitas kecocokan gabungan (CMP) adalah 1,089 x 10-28. Uji chi-kuadrat menunjukkan bahwa semua lokus STR lokus mengikuti Hardy Weinberg keseimbangan (p > 0,05). Semua lokus sangat polimorfik (PIC >0,5). Lokus TH01 adalah lokus STR polimorfik paling sedikit (PIC = 0.610), dan D13S317 dan D19S433 adalah yang paling polimorfik (PIC=0.690)

Analisis variabilitas genetik lokus SE33 oleh A. Barbaro menyimpulkan bahwa lokus SE33 sangat efektif polimorfik dan berharga tidak hanya untuk identifikasi forensik tetapi juga dalam kasus paternitas (Barbaro et al., 2015). Dalam sebuah studi di Kazakh populasi Xinjiang di barat laut Cina, lokus SE33 menunjukkan kekuatan diskriminasi yang paling signifikan. (Zhang et al., 2016). Sebuah penelitian oleh Jianye Ge, Arthur Eisenberg, dan Bruce Budowle menunjukkan bahwa lokus SE33 memiliki Average Kinship Index (AKI) tertinggi. dibandingkan dengan lokus lain (PentaE, D12S391, D1S1656, D2S1338, D18S51, FGA, D21S11, D8S1179, D7S820, vWA, D19S433, D13S317, D2S441, D3S1358, D10S1248, D16S539, TH01, CSF1PO, D5S818, DYS391, PentaD, D22S1045, dan TPOX) (Ge, Eisenberg dan Budowle, 2012).

Kekuatan gabungan diskriminasi dalam populasi Minangkabau (CPD) adalah 92,43% dan probabilitas kecocokan gabungan (CMP) adalah 1,089 x 10-28. Semua lokus sangat polimorfik (PIC >0,5). Hal ini menunjukkan bahwa 21 lokus tersebut dapat digunakan untuk forensic identifikasi menggunakan STR pada penduduk Minangkabau.

Kesimpulan dalam penelitian ini, Lokus TH01 merupakan alel yang sering ditemukan pada populasi Minangkabau. Lokus SE33 memiliki heterozigositas tertinggi, diskriminasi daya dan probabilitas kecocokan di antara 21 lokus STR. Semua lokus bersifat polimorfik (p>0,5) sehingga 21 lokus tersebut dapat digunakan untuk identifikasi forensik dan studi penduduk Minangkabau.

Penulis: Dr.Ahmad Yudianto,dr.SpF.M[K].,SH.,M.Kes

Informasi detail dari riset ini dapat dilihat pada tulisan kami di :

https://journals.athmsi.org/index.php/AJID/article/view/5801

Citra Manela, Rika Susanti, Djong Hon Tjong, Ahmad Yudianto, GENETIC ANALYSIS 21 SHORT TANDEM REPEATS (STR) LOCUS IN MINANGKABAU POPULATION, WEST SUMATERA, INDONESIA. Afr., J. Infect. Dis. (2022) 16 (2): 35-41